เจ้าอาวาสก่อนย้ายวัดมา ไม่ทราบว่ามีกี่รูป และชื่อใดบ้าง มีปรากฏอยู่ใน รายงาน ตรวจการศึกษามณฑลจันทบุรี ของพระสุคุณคณาภรณ์ เมื่อ พ.ศ. ๒๔๔๑ ว่า เจ้าอาวาส วัดคลองปูนในขณะนั้นชื่อ พระกราย อายุ ๓๐ พรรษา ๘ เมื่อมีการย้ายวัดมาสร้างใหม่ มีเจ้าอาวาสสืบต่อกันมา ดังนี้
ตั้งแต่ พ.ศ. ๒๕๕๒
พ.ศ.๒๕๓๘ - ๒๕๕๒
พ.ศ. ๒๕๒๖- ๒๕๓๘
ท่านพระครูอาทรพัฒนกิจ (พัฒนา ปิยวณฺโณ) (วงศ์จันทร์) ได้ลาสิกขาเมื่อวันที่ ๔ พฤศจิกายน พ.ศ. ๒๕๓๘
พ.ศ. ๒๕๑๗-๒๕๒๖
พระครูถาวรพัฒนคุณ (เจริญ ถาวโร ) (ระวัง) ได้มรณภาพ เมื่อวันที่ ๙ พฤศจิกายน พ.ศ. ๒๕๒๖
พ.ศ. ๒๔๘๙ – ๒๕๑๗
พ.ศ. ๒๔๘๑ – ๒๔๘๙
พระอธิการล้วน ได้ลาสิกขาเมื่อปี พ.ศ. ๒๔๘๙
พ.ศ. ๒๔๗๕ – ๒๕๘๑
พ.ศ. ๒๔๖๒ – ๒๔๗๕
พ.ศ. ๒๔๖๐ – ๒๔๖๒
พระอธิการเริ่ม(วิสมล) เริ่มบวชปี พ.ศ.๒๔๕๔ ครองเพศสมณะอยู่จำพรรษาได้ ๘ พรรษา ลาสิกขา เมื่อวันที่ ๗ มิถุนายน พ.ศ. ๒๔๖๒
ประมาณ พ.ศ. ๒๔๕๙ – ๒๔๖๐